清華大學(xué)醫學(xué)院成立于2001年，經(jīng)過(guò)20年的建設，已經(jīng)建立了強大的科研能力與專(zhuān)家團隊和系統的學(xué)生培養體系，積極為“健康中國”的國家目標貢獻成果與人才。著(zhù)名醫學(xué)科學(xué)家、兩院院士吳階平先生擔任首任院長(cháng)，生物物理學(xué)家趙南明教授、結構生物學(xué)家施一公院士、神經(jīng)科學(xué)家魯白教授、免疫學(xué)家董晨教授先后擔任常務(wù)副院長(cháng)。2016年9月，董晨教授擔任醫學(xué)院院長(cháng)。2020年12月，祁海教授擔任醫學(xué)院院長(cháng)。 　　

清華醫學(xué)院下設基礎醫學(xué)系、臨床醫學(xué)院、生物醫學(xué)工程系和公共健康研究中心，涵蓋了分子與細胞生物學(xué)、免疫學(xué)、腫瘤生物學(xué)、傳染病學(xué)、神經(jīng)科學(xué)、生物醫學(xué)工程學(xué)、公共健康學(xué)與臨床醫學(xué)八大學(xué)科。 在臨床方面，清華大學(xué)華信醫院、清華大學(xué)玉泉醫院、北京清華長(cháng)庚醫院是我院的附屬醫院，解放軍總醫院（301醫院）、北京醫院、中日友好醫院、北京積水潭醫院和北京神經(jīng)外科研究所（天壇醫院神經(jīng)外科）是我院的教學(xué)醫院。

2016年12月，醫學(xué)院下成立臨床醫學(xué)院，將進(jìn)一步整合基礎和臨床教學(xué)資源，提升臨床醫學(xué)博士培養質(zhì)量，建設住院醫師、專(zhuān)科醫師規范化培訓基地。